Prof. Henryk Skarżyński został uhonorowany nagrodą "Wizjonerzy XXI wieku", przyznawaną przez Tygodnik "Wprost", za wizję, pasję i sukces. Uroczysta gala odbyła się 7 grudnia 2016 r. w Starej Oranżerii w Łazienkach Królewskich w Warszawie.
Rada Centrum Studiów Zaawansowanych Politechniki Warszawskiej przyznała po raz trzeci swoje najważniejsze Wyróżnienie Laus tibi, non tuleris qui vincula mente animoque, które w tym roku otrzymał prof. Henryk Skarżyński. Symbolem tej łacińskiej sekwencji jest Kryształy Dwunastościan, zwany Kosmosem Pitagorasa, który jest przyznawany za osiągnięcia w budowaniu efektywnych przestrzeni badawczych i przełamywanie granic poznania. Uroczystość odbyła się 5 grudnia 2016 r. w Sali Senatu Politechniki Warszawskiej.
(…) - Bardzo dużo i bardzo mądrze opowiadano dziś o biznesie, o tym jak potrzebni i ważni są zarówno przedsiębiorcy, jak i pracownicy. Tę nagrodę rozumiem również, jako docenienie Waszej firmy w zakresie dobrego traktowania pracowników, które jest niezmiernie ważne w biznesie, w przedsiębiorstwach. Wasza firma wielu z nas kojarzy się ze sklepami, imprezami sportowymi, sponsoringiem, a teraz będzie się jeszcze kojarzyć z Piórkiem i z bardzo fajnym i ciekawym konkursem. Również bardzo dziękuję za te nagrody, które robią wrażenie. (…)